Gihtubより
Bandage-NGは、SPAdesやMEGAHITなどのde novoアセンブラが作成するアセンブリグラフを操作するためのGUIプログラムである。
重要: オリジナルのBandageレポのフォークである。新しい機能やバグが含まれている可能性があり、Ryan WickによるBandageと互換性がない可能性がある。
Documentation
Home · asl/BandageNG Wiki · GitHub
Bandage-NG 2022.07 is out. Lots of new features including new path query UI, support for loading GAF and SPAligner TSV paths and many other things including usual improvements in memory consumption and processing speed.https://t.co/r4o8QfqArP
— Center for Algorithmic Biotechnology (@bioinf_spbu) August 1, 2022
インストール
リリースからダウンロードできる。ビルドするにはGUIアプリ開発のフレーワークであるQt 6などが必要。macosで動作確認した(mac studio使用)。
https://github.com/asl/BandageNG/releases
本体 Github
実行方法
起動してグラフを読み込んだところ。
目立ったインターフェースの変化はない。
オリジナルのBandageよりも大量のアセンブリグラフファイルを読み込んだ時の応答性が改善されているらしい。という発表当時のツイートを記憶しているのですが、該当するツイートが見つけられませんでした。すみません。
引用
GitHub - asl/BandageNG: a Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily
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