lncRNA
reference genome
Insects
UTR
lncRNA
Horizontal gene transfer (HGT)
Gene family
Viruses
web tool
Nucleic Acids Research
2022
昆虫は地球上で最大の動物群であり、資源の提供、病気の媒介、農作物生産の被害など、人間の生活に大きな影響を及ぼしている。近年、昆虫のゲノムや遺伝子のデータが大量に生成されている。これらのリソースを管理、共有、マイニングするためには、包括的な…
非コードRNAは転写プロセスにおいて重要な役割を果たし、様々な生物学的機能の制御に関与している。特にmiRNAやlncRNAが重要である。しかし、既存のシグナル伝達パスウェイデータベースには、miRNAやlncRNAに関する情報は含まれていない。そこで本著者らは、…
2022 1/27追記 トータルRNAシーケンス(total-RNA-seq)により、コーディングとノンコーディングの両方のトランスクリプトームを同時に研究することができる。しかし、計算パイプラインは従来、特定のバイオタイプに焦点を当て、total-RNA-seqデータセットが…
ロングノンコーディングRNA(lncRNA)とは、200塩基より長いノンコーディング転写物を指す。現在までに、約58,000のlncRNAが様々な細胞型・組織に集積されているが、そのうち79%が新規性の高いものであり、その生物学的機能は未だ解明されておらず(Iyer et a…