macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

codon table

塩基配列データから遺伝暗号(コドンテーブル)を予測する Codetta

遺伝暗号は「frozen accident」(参考)であると提唱されてきたが、過去40年間の代替遺伝暗号の発見により、ある程度進化しうることが明らかになった。ほとんどの例はanecdotallyに発見されたものであるため、コドン置換の進化の軌跡や、なぜあるコドンがよ…