macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

SVM

バクテリアの表現型をゲノムから予測する Traitar

配列決定されたゲノムの数は飛躍的に増加しており、データの生成からゲノムの解釈に至るまでのボトルネックが大きく変化している。形質は、細菌を特徴づけたり区別したりするためによく用いられ、微生物群集組成の原動力となっていると考えられるが、ほとん…