macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2003

大規模な微生物の比較ゲノミクスのためのモジュラー式のツール PanACoTA

2021 9/8 修正 2021 9/9 誤字修正 2021 9/10 prokkaのバージョンによるエラー修正 (依存するライブラリの関係でpython3.7の環境に導入するように修正した), --prodigalのオプション消去 2021 10/15 docker imageのコマンド追記 2021 10/18 annotate追記 2021…

アノテーションパイプライン PASA

2020 10/4 コマンドの間違い修正 2020 10/5 アップデートのコマンド修正 ゲノム配列に対する発現配列データのスプライスアラインメントは、真核生物ゲノムにおける遺伝子の包括的なアノテーションにおいて重要なツールであることが証明されている。これによ…