MNase-seq
2017
Preprint
bam/sam
結果の視覚化 (visualization)
CRAN
MNase-seq
mouse
yeast
heatmap
2D plot
ATAC-seq
ChIP-Seq
ヌクレオソーム、これは147 bpのDNAがA約1.7ターンでヒストンオクタマーに包まれる真核生物のDNAパッケージングの基本単位である（Luger、et al、1997）。標的部位へのDNA結合因子のアクセスは、これらの部位がヌクレオソームフリー領域（NFR）にある場合、…
library
bam/sam
結果の視覚化 (visualization)
human exome
human genome
ChIP-Seq
bed
promoter
filtering
evaluation tool
2016
Nucleic Acids Research
bigwig
MNase-seq
2D plot
deeptools2のペーパーより ハイスループットシーケンスデータのデータの分析は、引き続き研究者にとって大きな課題となっている。ハイスループットシーケンシングを用いた実験の多様性が急速に高まっているため、分析パッケージの数が増加し、洞察に富んだ視…
