macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

mix-assembly

細菌ゲノムのロングリードコンセンサスアセンブリを行う Autocycler

2025/09/03論文追記 ロングリードシーケンスにより完全な細菌ゲノムアセンブリが可能になるが、個々のアセンブラは不完全であり、しばしば配列レベルや構造エラーが生じる。Trycyclerを用いたコンセンサスアセンブリは精度を向上させることができるが、自動…

高速かつメモリ使用量の少ないメタゲノムアセンブリツール MEGAHIT

2019 5/6 インストール方法修正、5/7 パラメータ追記、5/15 タイトル修正、5/19 リンク追加、5/17 タイトル再修正、パラメータ修正、6/3 コメント追加、7/27 condaインストール追記 2021 5/7 helpと インストール手順更新、7/21 リンク追加 2022 2/19 メモ追…