macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

Methods in Ecology and Evolution

メタゲノムデータのLCA推定と分類学的プロファイリングを行う ngsLCA 

環境サンプルから生成されたメタゲノム・データは、現代および古代の生物群集の解析においてますます一般的になってきている。この種のデータから分類学的プロフィールを得るためには、DNA配列を大規模なゲノム参照データベースに対してアラインメントし、各…