t-SNE
2021
Microbiome (Journal)
shiny
abundance estimation in metagenomics data
metatranscriptome
metagenome
amplicon sequence
相関分析
結果の視覚化 (visualization)
回帰分析
クラスター分析
BIOM
ASV (amplicon sequence variant)
UMAP
t-SNE
biomarker
OTU
ヒトの健康や病気の形成に腸内細菌叢が果たす複雑な役割は、培養に依存しない分子ベースのハイスループットシーケンシング技術が利用できるようになったこともあって、近年、精力的に調査・研究が行われている。ヒトのすべての宿主は、平均500~1000種の異な…
シーケンシング技術の継続的な進歩により、「オミクス」というレンズを通して生物学的システムを理解する上での限界は、もはやデータの生成ではなく、それを解析する能力にある。重要なことは、この豊富な「-omics」データの多くは一般に公開されており、さ…