macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

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AF2の複合体構造予測が生物学的なPPIかどうかを判定する分類器 PPIscreenML

2026/08/15 間違いを修正 タンパク質間相互作用は、ほぼすべての細胞プロセスの基盤である。AlphaFold2(AF2)のようなタンパク質構造予測法の登場により、特定のタンパク質ペアのモデルは多くの場合、非常に正確に構築できるようになった。しかし、与えられ…

病原性因子と抗生物質耐性遺伝子を同時に予測する HyperVR

感染症は、公衆衛生と世界経済に深刻な問題を提起している。病原体が宿主細胞に接着し、繁殖し、ダメージを与えることを可能にするのは病原性因子(VFs)であり、抗生物質耐性遺伝子(ARGs)は、通常であれば治癒可能な治療を回避することを可能にする。VFs…

データベースのゲノム情報とAMR耐性/感受性情報から細菌のAMR表現型を予測する VAMPr

2020 3/37 タイトル修正 Antimicrobial resistance(AMR)は、公衆衛生に対する脅威の増加である。 AMRを決定する現在の方法は、非効率的な表現型アプローチに依存しており、多くの病原体と抗菌薬の組み合わせのAMRメカニズムの理解が不完全なままとなってい…