macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

Dual coordinate VCF

BAM/SAM/CRAM、VCF、FASTQ、GFF3の効率的な圧縮器 genozipのバージョン14アップデート

2022/12/05, 06 HP更新 Genozip は、広く利用されている FASTQ、BAM、VCF ファイル形式を含む、幅広いゲノムデータの圧縮を行う。ここでは、BAMおよびCRAMファイルの圧縮に焦点を当てた、Genozip技術の最新の進歩を紹介する。様々な種類の研究(全ゲノムシー…

効率的なゲノムファイル(FASTQ、SAM/BAM/CRAM、VCF、GVF、FASTA、PHYLIP、23andMe)の圧縮器 Genozip

2021 7/20 DocumentaitonのURL修正 2021 10/9 コマンド追記 2021 11/9 追記 ゲノムデータのための汎用的で機能が充実した圧縮ソフトウェアであるGenozipを紹介する。Genozipは、汎用性(一般的なゲノムファイル形式をすべてサポート)、高圧縮率、高速性、機…