macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

Cell Systems

Minimizer-spaceの de Bruijn graphsを構築し、超高速・低メモリアセンブリを行う rust-mdbg

2021 9/17 論文引用 2023/08/03 更新(metaMDBGとしてまちがって更新していた分を移動) DNAシーケンサーのデータは、リードが長くなり、シーケンスエラー率がますます低くなる傾向にある。ここでは、このようなリードをゲノムにアセンブルする問題に注目し…