macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

EC number

キュレーションされたgene lossに関するデータベース Gene Loss DB

分子データベースは実験生物学者にとっても計算生物学者にとっても不可欠なリソースである。高品質なゲノムアセンブリの急速な増加により、脊椎動物の多様なグループにわたる系統特異的適応に関連する二次的な遺伝子消失事象について記述した出版物が急増し…

対比学習による酵素機能の予測ツール CLEAN

酵素の機能アノテーションは基本的な課題であり、数多くの計算機ツールが開発されている。しかし、これらのツールの多くは、研究が進んでいないタンパク質や、これまで解明されていない機能や複数の活性を持つタンパク質について、enzyme commission(EC)番…