correspondence
2019
BMC Genomics
correspondence
ゲノム比較 (comparative genomics)
ANI
assembly
Reference-assisted assembly
annotation
contigのscaffolding
misassembly
Pacbio
Nanopore long read
bacteria
bacterial annotation
archaea
BLAST
rRNA
私(論文のオーサー;hereafter、私)の最近の研究では、低品質の細菌ゲノム配列(ここでは「多くのコンティグを含むゲノム配列アセンブリ、最終的には明らかなミスアセンブリと未解決のプラスミド配列」と定義)を扱ってきた。主要な問題は、ゲノムのクオリ…