macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

Protein language model

自然言語からの新規タンパク質設計を目指す Pinal

デノボタンパク質設計は、タンパク質工学における基本的な追求であるが、現在のディープラーニングアプローチは、その狭い設計範囲によって制約されたままである。Pinalは、自然言語理解とタンパク質設計空間の架け橋となり、人間の設計意図を新規タンパク質…

タンパク質言語モデルにより正確で高速なリモート相同性配列検索を行う PLMSearch

Homologous protein searchは、タンパク質のアノテーションや解析に最もよく使われる手法の一つである。構造検索と比較して、配列のみから遠い進化関係を検出することは依然として困難である。ここでは、配列のみを入力とするHomologous protein searchメソ…