Nomenclature
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
1997
bacteria
archaea
2020
taxonomic assignment
taxonomy ID
Nomenclature
type strain
2020 9/3、9/6 誤字修正 1997年の論文 このリストには、International Journal of Systematic Bacteriologyに掲載された細菌の正式名称がアルファベット順に年代順に掲載されている。5,569種(1996年12月31日現在)を網羅しており、インターネット上で入手可…
あらゆる生物学的データは分類学的データと密接にリンクしており、いくつかのバイオインフォマティクス分析は目的を達成するために分類学的情報に依存している。メタゲノミクス、臨床法医学、その他の分野では、サンプル中に存在する生物を同定し、グループ…
taxonomic assignment
生物種の推定 (taxonomic profiling)
ANI
database
ゲノム比較 (comparative genomics)
分子系統樹
evolution
archaea
Nomenclature
2019
Bioinformatics
2020
Nature Biotechnology
GTDB
2019 10/28 誤字修正、コメント追加、11/5 誤字修正、捕捉追加、11/6 追記 2020 2/21 インストールコマンド修正、3/4 ツイート追加、4/21 インストールの説明を修正、8/23 補足 、9/9 KBase補足、論文リンク追加、12/28 データベースダウンロードリンク更新 …
2019
Nucleic Acids Research
bacteria
database
web tool
archaea
phenotype
morphology
taxonomic assignment
生物種の推定 (taxonomic profiling)
Nomenclature
2020 10/16 タイトル変更、誤字修正 2021 10/7 画像一部更新 原核生物は、研究開発との関連性が高い多種多様な表現型形質を発現する。バクテリアのメタデータのホットスポットとしてよく利用できるのは、最初の(一次)文献で報告された種の説明と、生物資源…