macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

FPGA

配列アライメントのための高速かつ効率的なプリアライメントフィルタ Shouji

ほとんどのバイオインフォマティクス分析における最も基本的な計算ステップの1つは、2つのゲノム配列間の相違点/類似点の検出である。Edit distanceとペアワイズアラインメントは、このステップを実現するための2つのアプローチで、近似文字列マッチングとし…