macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

transcriptional regulator

ターゲットの転写制御因子を予測したりピークのアノテーションを行うウェブツール AnnoMiner

遺伝子発現の制御には、転写因子による正確な転写プログラムと、エピジェネティックな事象の組み合わせが必要である。近年、エピゲノムやトランスクリプトームの技術が進歩し、さまざまな遺伝子制御メカニズムが解明されてきた。しかし、転写因子とエピジェ…

エピゲノムプロファイルを用いた転写因子予測ツール BART

ある遺伝子セットを制御する機能的な転写因子の同定は、遺伝子制御研究において重要な問題である。従来の転写因子の同定方法であるDNA配列モチーフ解析では、特定の因子の機能的な結合を予測することができず、遠位のエンハンサーに結合する因子を検出するに…