GSEA
Bioconductor
KEGG pathway
The Innovation
2021
ORA (Over-representation Analysis)
RNA seq
結果の視覚化 (visualization)
GSEA
2022/05/30 タイトル修正 2024/03/06 追記 機能エンリッチメント解析は、生命科学におけるハイスループットなオミックスデータを解釈するために極めて重要である。この種のツールは、できるだけ多くの生物について最新のアノテーションデータベースを使用す…
2021
Preprint
Pathway
gene set enrichment analysis
GSEA
docker
ORA
human genome
web tool
KEGG pathway
過去20年間で、パスウェイデータベースとパスウェイエンリッチメント法は着実に発展してきた。しかし、パスウェイデータの出現に伴い、データベース間の相互運用性が改善されていないため、複数のデータベースから得られたパスウェイ知識をパスウェイ・エン…
RNA seq
Genes
2020
GEO
differential exon usage (DEU)
differential alternative splicing (DAS)
differential transposable element expression (DTE)
allele-specific gene expression (ASE)
GO enrichment analysis
KEGG pathway
GSEA
過去10年間で、大量のRNAシーケンス(RNA-seq)データが公開リポジトリに寄託され、さらに前例のない速度で生産されている。しかし、汎用性が高く、RNA-seqデータセットの包括的な解析を合理的に行うことができる、ポイント&クリックのインターフェースを持…