macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

replicates

Biological replicatesの品質を調べるためのTrinityのPtRスクリプト

Trinityに付属するスクリプトPtRは、生物学的複製が十分に相関していることを確認し、またサンプル間の関係を調査するためのユーティリティツールである。Trinityのabundance_estimates_to_matrix.plなどを使って得た発現量の行列ファイルを使う。Trinityの…