macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

dispensable genes

特定の枝で正の選択が起きたか調べる aBSREL

2026/01/14追記、 1/23追記 過去20年間にわたり、コドン置換モデルを用いた比較配列解析は、分子データから自然選択のシグネチャーを検出するための強力かつ一般的な手法へと磨き上げられてきた。多くの研究は、ω比で定量化された配列に対する選択圧をコドン…

ディスペンサブル遺伝子(dispensable genes)を評価する QUOD

系統(種、属、高次のクレード)における遺伝子の非消耗性は、多くのゲノムシーケンスプロジェクトがパンゲノームレベルに移行するにつれて重要性を増している。ほとんどの解析では、遺伝子を、調査対象となったすべてのゲノムに存在する「コア遺伝子」と、…