differential exon usage (DEU)
2022
Bioinformatics
GTF
intron
UTR
transcription start site (TSS)
differential exon usage (DEU)
independent intron
bed
Ensembl
遺伝子中心のバイオインフォマティクス研究では、遺伝子モデルを操作して、スプライスサイト、プロモーター、独立イントロン、非翻訳領域(UTR)など、遺伝子の様々な特徴を計算または抽出することが頻繁に行われる。遺伝子モデルは、GTF(Gene Transfer Form…
RNA seq
Genes
2020
GEO
differential exon usage (DEU)
differential alternative splicing (DAS)
differential transposable element expression (DTE)
allele-specific gene expression (ASE)
GO enrichment analysis
KEGG pathway
GSEA
過去10年間で、大量のRNAシーケンス(RNA-seq)データが公開リポジトリに寄託され、さらに前例のない速度で生産されている。しかし、汎用性が高く、RNA-seqデータセットの包括的な解析を合理的に行うことができる、ポイント&クリックのインターフェースを持…