macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2025-01-13から1日間の記事一覧

MEGA12

Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA12)ソフトウェアの第12版を紹介する。この最新バージョンでは、最適な置換モデルの選択と、最尤法(ML法)を用いた系統のブートストラップ検定に必要な計算時間を短縮することで、多くの重要な改良が加えられ…

環状DNA配列の開始位置を指定位置に回転させる Rotate

環状DNA分子(すなわち、ほとんどの細菌、ウイルス、プラスチドゲノム)に由来する配列は、アラインメントを含むほとんどの下流解析において、線状化され、共通の開始位置に回転されることが期待される。これは一般的で簡単な作業であるにもかかわらず、利用…