macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

POD5

ロングリードのメタゲノムアセンブラ myloasm

2025/09/09 プレプリント引用 ロングリードメタゲノムアセンブリは、マイクロバイオームからの完全なゲノム復元を約束する。しかし、メタゲノムの複雑性は課題をもたらす。本著者らは、PacBio HiFiおよびOxford Nanopore Technologies (ONT) R10.4ロングリー…

POD5ツール

マニュアルより POD5は、ナノポアシーケンスデータを簡単にアクセスできる方法で保存するためのファイルフォーマットである。このフォーマットはApache Arrowを用いて格納され、標準的なツールを用いて多くの言語でデータを利用することができる。POD5には、…