UTR
GFF
GTF
format conversion
ab initio gene prediction
reciprocal best hit
filtering
intron
UTR
ENA
eukaryotic genome annotation
pseudogene
mask
2023/02/27 intron addに追記 HPより AGATは、あらゆる種類のGTFやGFFの欠落情報(特徴や属性)をチェック、修正、追加し、完全でソートされた標準的なgff3形式を作成する能力を備えている。長年にわたり、GTF/GFFフォーマットファイルに関連するあらゆるタ…
非モデル生物のアノテーションは未解決の問題であり、特に非翻訳領域(UTR)の検出が重要である。UTRの正確なアノテーションはトランスクリプトーム解析において各遺伝子の発現を正確に把握するために非常に重要であるが、アノテーションパイプラインではほ…