multi-fasta alignment (MAF)
docker
Singularity
PAF format
multi-fasta alignment (MAF)
format conversion
chain format
dot plot
結果の視覚化 (visualization)
2025
Bioinformatics
SNV
small indel
structural variations (SV)
ロングリードシーケンス技術の急速な発展により、個体完全長ゲノムの時代が近づいている。本著者らは、様々な全ゲノムアラインメント（WGA）フォーマットをサポートし、アラインメントの変換、処理、評価、可視化のための実用的なツールを提供する、クロスプ…
2019
Preprint
multi-fasta alignment (MAF)
結果の視覚化 (visualization)
ゲノム比較 (comparative genomics)
synteny_block
conserved domain
bacteria
archaea
JOSS
2020 9/24 論文引用 完全な原核生物ゲノム間の構造的変化を視覚化することは、系統の違いの遺伝的基盤を特定するために重要である。これは通常、連続したペアワイズ比較または複数の線形の結果を線形レイアウトまたは環状レイアウトで表示することで実現され…
2020 9/25 help修正 タイトルの通りのコマンド。 HP EMBOSS: cons インストール macos10.12の miniconda3-4.3.21環境でテストした。 condaやbrewで導入できる。 #bioconda (link) conda install -c bioconda -y emboss #homebrew brew install emboss > cons…
