macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

SLOW5 format

ナノポアシグナルデータを効率的かつ並列に解析するための SLOW5フォーマットを扱う slow5tools

現在、最もポピュラーなシグナルレベル解析は、ソフトウェアNanopolish/f5cを用いたDNAメチル化プロファイリングである。この使用例をもとに、ハイパフォーマンス・コンピューティング(HPC)システムでのFAST5データ解析について解析した(論文補足説明2)…