macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

PLM

タンパク質言語モデルの配列表現の直接比較に基づいて遠隔相同性検出を行う pLM-BLAST

配列比較による相同性の検出は、タンパク質の機能と進化の研究における典型的な最初のステップである。この研究では、タンパク質言語モデルのこのタスクへの適用可能性を探る。pLM-BLASTはBLASTにインスパイアされたツールであり、タンパク質言語モデルProtT…

タンパク質言語モデルにより正確で高速なリモート相同性配列検索を行う PLMSearch

Homologous protein searchは、タンパク質のアノテーションや解析に最もよく使われる手法の一つである。構造検索と比較して、配列のみから遠い進化関係を検出することは依然として困難である。ここでは、配列のみを入力とするHomologous protein searchメソ…