PAF format
human genome
clinical and diagnostic
circos
structural variations (SV)
variant
windowsツール
GUIツール
2016
Genome Biology
web tool
PAF format
dot plot
genome browser
2022/05/21 ツイート追記 HPより JBrowseは、JavaScriptとHTML5で作られた高速でフル機能のゲノムブラウザです。Webサイトやアプリに簡単に組み込むことができますが、スタンドアロンのWebページとして提供することも可能です。 version1との機能比較表。 HP…
2019,11,15 paftools.js call のコマンドエラー修正 2019 11/26 vatiantコールコマンドのエラー修正 2021 7/21 コマンド例追加 Minimap2には、PAFフォーマットのアライメントを処理する（java）スクリプトpaftools.jsが付属している。paftoolsを使うことで、…
2019
連鎖地図
assembly
Algorithms for Molecular Biology
Pacbio
Nanopore long read
Reference-assisted assembly
assembly graph
PAF format
ハイスループットな第二世代シーケンシング技術は、大規模な新規アセンブリを可能にし、そして一般化した。しかしながら、それらのショートリード長は今日でも大きな問題を引き起こしている。１分子リアルタイムシークエンシング（SMRT）およびオックスフォ…
