co-occurrence
snakemake
2022
Preprint
metagenome
automated pipeline
Binning (metagenomics)
co-occurrence
Marine Metagenomics
テスト失敗
2022/06/17 誤字修正 メタゲノム-アセンブルゲノム(MAG)は、メタゲノムデータから回収された個々のゲノムを表す。MAGは、未培養微生物のゲノム多様性の解析や、自然環境における機能・代謝の可能性を明らかにするために非常に有用である。近年の計算機開発…
2021
Bioinformatics
co-occurrence
orthologue
web tool
bacteria
phylogenetic marker genes
KEGG
TIGRFAM
BLAST
PFAM
系統プロファイリング」として知られるゲノム間のco-occurring genesを統計的に検出する方法は、遺伝子間の機能的関連を推測するための強力なバイオインフォマティクス技術である。系統樹データベースのサイズと複雑さ、系統樹構造の考慮の難しさ、ゲノムア…