AI
タンパク質間相互作用（protein-protein interactions; PPIs）は、生物学的機能に不可欠である。共進化解析および深層学習（DL）に基づくタンパク質構造予測によって、細菌や酵母では包括的なPPI同定が可能になってきたが、より複雑なヒトプロテオームに対し…
バイオインフォマティクスWebサーバーは、豊富な可視化機能を備えた専用インターフェースを通じてデータセットの対話的探索を可能にする、現代の生物医学研究における重要な資源である。しかし、主として人間を中心に設計されているため、大規模言語モデル（…
科学分野の基盤モデルは、多様なデータモダリティから高次元の表現を学習するが、それらが具体的に何を符号化しているのか、またその知識をどのように抽出するのかは、依然として未解明の課題である。本研究では、70億パラメータを持つゲノム基盤モデル「Evo…
AI推敲済み Transformerは機械学習に革命をもたらしたが、その内部構造は多くの人にとって依然として不透明である。そこで本著者らは、非専門家がGPT-2モデルを通してTransformerについて学ぶことができるように設計されたインタラクティブな視覚化ツール、T…
Codexのアップデートにより、いつでも使える Voice dictation 機能が追加されました。これを使うと、有料のサブスクリプション型音声入力サービスを使わなくても、実用的な音声入力を常に利用できます。条件はCodexが起動中であることだけです。 https://dev…
2026/05/07 誤字修正, 5/8 Fast search => Fast Research Google NotebookLMは、読み込ませた論文や資料をもとに、要約や質問応答ができるAIノートブックです。複数の論文を読み込ませて論点を整理したり、チャット形式で質問したりと多彩な利用法があります…
OpenAIのCodexは、ChatGPT上で動作する、自然言語指示でコードの生成・修正・テスト・ファイル編集を自律的に行う高度なコーディングエージェントです。cluade codeとともに広く使われています。軽く試してみましょう。 HP https://openai.com/ja-JP/codex/ …
高品質なバイオインフォマティクスプロットは、生物学研究、特に論文発表の準備において重要である。しかし、論文発表に適したプロットを作成するには、学習曲線が長く、コーディング環境の設定が複雑になるという課題がつきまとう。そこで本稿では、バイオ…
2026/04/10 追記 2026/04/15 claude codeの部分を修正、4/25追記 久しぶりのブログ更新です。全然更新できず申し訳ありません。 2026年に入ってから、エージェントタスクに関する話題が一気に加速しています。やや誇張かもしれませんが、コミュニティでは毎…
出版物レベルの可視化を作成することはバイオインフォマティクスにおいて不可欠であるが、コーディングの専門知識が限られている研究者にとっては依然としてボトルネックとなっている。大規模言語モデル（LLM）はコード生成に長けているが、ライブラリの依存…
