soil
2022
Preprint
ヒト口腔 (human oral)
ヒト腸内 (human gut)
metagenome
mOTU
wastewater
Marine Metagenomics
animal
soil
mouse
abundance estimation in metagenomics data
Microbiome (Journal)
2022/09/07 誤字修正、オプション追記, 10/17 インストール手順修正 2022/12/18 論文引用 2024/02/05 追記 分類学的プロファイリングは、生物試料中の微生物の相対的な存在量を検出・定量することを目的としたマイクロバイオーム研究の基本的なタスクである…
2022
Nucleic Acids Research
gene cluster
web tool
KEGG
eggNOGs
PFAM
bacteria
archaea
soil
系統解析
分子系統樹
synteny_block
シンテニー保存性の解析は、原核生物の未知遺伝子の潜在的な機能的役割を調査するための確立された方法論である。しかし、ゲノムコンテキストの再構築と可視化を行うバイオインフォマティクスツールは、通常、計算速度に依存し、狭い分類学上の範囲に限定さ…