酸素は微生物の分布と活動の主要な駆動力である。酸素濃度を現場で測定することはしばしば困難であるため、一つの解決策として、細菌を酸素濃度の生物指標として用いることが考えられる。細菌は偏好気性細菌から偏嫌気性細菌まで多岐にわたるため、細菌群集…

2022/09/07 誤字修正、オプション追記, 10/17 インストール手順修正 2022/12/18 論文引用 2024/02/05 追記 分類学的プロファイリングは、生物試料中の微生物の相対的な存在量を検出・定量することを目的としたマイクロバイオーム研究の基本的なタスクである…

シンテニー保存性の解析は、原核生物の未知遺伝子の潜在的な機能的役割を調査するための確立された方法論である。しかし、ゲノムコンテキストの再構築と可視化を行うバイオインフォマティクスツールは、通常、計算速度に依存し、狭い分類学上の範囲に限定さ…