回帰分析
2022
Frontiers in Genetics
web tool
shiny
PCA
回帰分析
相関分析
heatmap
volcano plot
venn diagram
Figure (scientific illustration)
オミックスデータは大量に生産され、通常、高度な可視化解析が必要とされる。これらの解析にはプログラミングのスキルが必要な場合が多く、実験生物学者にとっては難しい。したがって、より使いやすいツールが早急に求められている。 本発表では、オミックス…
shiny
Computational and Structural Biotechnology Journal
2021
volcano plot
web tool
heatmap
Proteomics
RNA seq
回帰分析
ボルケーノプロットやその他の分析プロット(相関プロット、アップセットプロット、ヒートマップなど)は、トランスクリプトームやプロテオーム解析において重要なデータ可視化方法として機能する。これらのプロットをカスタマイズして作成することは、発現…
2021
Microbiome (Journal)
shiny
abundance estimation in metagenomics data
metatranscriptome
metagenome
amplicon sequence
相関分析
結果の視覚化 (visualization)
回帰分析
クラスター分析
BIOM
ASV (amplicon sequence variant)
UMAP
t-SNE
biomarker
OTU
ヒトの健康や病気の形成に腸内細菌叢が果たす複雑な役割は、培養に依存しない分子ベースのハイスループットシーケンシング技術が利用できるようになったこともあって、近年、精力的に調査・研究が行われている。ヒトのすべての宿主は、平均500~1000種の異な…
初心者向け
結果の視覚化 (visualization)
インフォマティクス解析をサポートするツール
GUIツール
windowsツール
heatmap
PCA
ANOVA
回帰分析
相関分析
クラスター分析
3/330 誤字修正、図を追記 2020 3/31 追記 2020 5/4 v2.0リリース追記 2020 5/12 統合TVのリンク追加 BioVinciのabout usより BioTuringは、若くてモチベーションが高いバイオインフォマティシャンで構成されたチームで、次世代のバイオインフォマティクス…