Frontiers in Plant Science
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核ゲノムと比較して、ミトコンドリアゲノム(mitogenomes)は小さく、通常は数十個の遺伝子しかコードしていない。それでもなお、遺伝子やその構造を特定することは困難であり、多大な時間を要する作業となり得る。ミトコンドリアゲノムのアノテーションを行…
植物抵抗性遺伝子は、様々な病気や害虫に対する植物の防御システムにおいて極めて重要である。これらの植物特異的遺伝子は、植物に侵入する病原体に関連する特定の分子パターンを識別するタンパク質をコードしている。これらの抵抗性遺伝子が活性化されると…
(途中まで省略) アノテーション付きのリファレンスゲノムを持つ生物のハイブリッドシーケンシング研究により、Iso-Seqリードを含める転写産物アイソフォームの選択的スプライシングに対する感度が向上したという証拠が見つかった。(一文省略) Iso-Seqリ…
RNA seq
ゲノム比較 (comparative genomics)
pan-genome
ANI
sequence clustering
Applied and Environmental Microbiology
2013
2017
Frontiers in Plant Science
docker
plant
2018 9/27 引用の誤り修正 2020 4/13 インストール手順とヘルプ追記, タイトル修正 2020 4/14 インストール手順修正 2020 5/27 タイトル修正 種のパンゲノムとは、その種のすべての個体に見られるすべての遺伝子とノンコーディング配列の集合体と定義される…