macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

popANI

メタゲノムデータから集団の微細多様性をプロファイリングする inStrain

同種の微生物細胞が共存すると、栄養嗜好から病原性までの表現型に影響を与える遺伝的変異を示すことが多い。本発表では、メタゲノムのペアエンドリードを用いて、全ゲノムにわたる集団内の遺伝的多様性(マイクロダイバーシティ)をプロファイリングし、マ…