miniprotを使うことでゲノムからのBUSCO評価の精度と速度を改善したcompleasm

2023/07/01 名前をminiBUSCOからcompleasmに差し替え 2023/09/29 論文引用ゲノムアセンブリの完全性評価は、ゲノムデータの正確性と信頼性を評価する上で重要である。不完全なアセンブリは、遺伝子予測、アノテーション、その他のダウンストリーム解析にお…

2023-05-23

ゲノムアセンブリを評価する WebQUAST

2023 Nucleic Acids Research assembly evaluation tool web tool misassembly BUSCO

ゲノミクス研究において、適切なゲノムアセンブリを選択することは、ダウンストリーム解析の鍵となる。しかし、多くのゲノムアセンブリツールが存在し、その実行パラメータは非常に多様であるため、このタスクは困難である。また、既存のオンライン評価ツー…

2021-08-14

BUSCO v5

2021 Molecular Biology and Evolution phylogenetic marker genes orthologue contamination evaluation tool de novo transcriptome eukaryotic genome annotation duplicate removal in primary genome assemblies BUSCO

2021 8/14 誤字修正 2021 11/29 誤字修正 2022/06/08 インストールのバージョン更新, 7/3 追記, 7/20 追記 2024/03/07 追記, 3/16 BUSCOv5.7.0について追記、06/10 誤字修正ゲノムデータやメタゲノムデータの品質を評価する方法は、ゲノムアセンブリを助け…