MAF
過去10年間で、3300以上のゲノムワイド関連研究（GWAS）が行われている。ほぼすべてのGWAS研究は、主図または補足図としてマンハッタンプロットを提供している。いくつかのソフトウェアパッケージがマンハッタンプロットを生成することができるが、それらは…
TCGA
COSMIC
BMC Medical Genomics
2019
MAF
VCF
結果の視覚化 (visualization)
tumor
cancer driver genes
metadata
web tool
cohort
CoMut plotは、ガン研究のpublicationsで、ガンコホートにおける突然変異の分布を視覚的に要約したものとして広く使用されている。この要約プロットは、遺伝子変異率とサンプルの変異負担を関連する臨床的詳細とともに調べることができ、サンプル間の遺伝子…
進化的比較ゲノム解析および集団ゲノム解析は、2つ以上のゲノム間の相同なヌクレオチド位置を記録するゲノム配列のアラインメントに基づいている。遺伝子アラインメントは３種類の文字のedit（ミスマッチ、挿入および欠失）のみを用いて記載されているが、ゲ…
