macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

microbial populations

マイクロバイオーム群集検出のためのウェブツール MiCoDe

Microbiome Community Detector (MiCoDe) は、ベイジアン加重確率的ブロックモデルを用いて微生物分類群のネットワークをコミュニティにクラスタリングする、無料の使いやすいウェブツールである。MiCoDeはデータを自動的にフィルタリングし、高次元性、構成…

MetaPop

微生物とそのウイルスは、海や土壌からヒトやバイオリアクターに至るまで、地球の生態系を動かす隠れたエンジンである。現在では、遺伝子マーカーによるアプローチは、ゲノム解析による個体群間(マクロダイバーシティ)および個体群内(マイクロダイバーシ…