macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2025-05-02から1日間の記事一覧

種の分岐年代に関するリソース TimeTree 5 (TToL5)

生命のタイムツリー・プロジェクトの成果である「TimeTree of Life」リソースの第5版(TToL5)を発表する。このプロジェクトは、公開されているモレキュラータイムツリーを統合し、進化に関する知識を誰でも簡単に利用できるようにすることを目的としている…

AAIを高速に推定する FastAAI

環境や臨床由来の微生物叢(マイクロバイオーム)を記述するうえで、全ゲノムの類縁性推定および分類学的同定は、重要なバイオインフォマティクスの課題である。種レベルの近縁な微生物やウイルスゲノムの類縁性を推定するためには、ゲノム全体の平均ヌクレ…

系統樹の可視化と操作のための柔軟でモジュール性のGUIソフト TreeViewer

系統樹は、分類群間あるいは遺伝子間の進化的関係を示す。樹形図は結果やデータを提示する際に非常に重要であり、明確で効果的なプロットを作成することで、研究者は多くの種類の進化パターンを説明することができる。しかし、系統樹を作成するのは時間のか…