macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

cancer

De novoでメタゲノムのbiological marker(サンプル間に共通する領域)を探す MetaMarker

全メタゲノムシーケンス(WMS)は微生物群集を研究するための新しいアプローチである。研究者らはWMSを使用してヒトのマイクロバイオームが結腸癌、細菌性膣炎、糖尿病、クローン病などのさまざまな疾患と密接な関係があることを発見した(Cho and Blaser、2…

真菌群集を解析するユーザーフレンドリーなwebサーバー DAnIEL

ヒトの体内や体の中には、あらゆる生物界を代表する何兆もの微生物が生息しており、宿主の発生や生理に重要な役割を果たしている。この10年間で、細菌の配列を解析するためのオンラインツールやサーバーが十数種類開発され、パブリックドメインでアクセスで…