macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

Plant Methods

ディスペンサブル遺伝子(dispensable genes)を評価する QUOD

系統(種、属、高次のクレード)における遺伝子の非消耗性は、多くのゲノムシーケンスプロジェクトがパンゲノームレベルに移行するにつれて重要性を増している。ほとんどの解析では、遺伝子を、調査対象となったすべてのゲノムに存在する「コア遺伝子」と、…

ハイスループットDNAライブラリ作成に適したDNA抽出プロトコル

最近、次世代シーケンシング(NGS)を用いた、シーケンスによるジェノタイピング(GBS)などのハイスループット分子マーカー技術が開発された。これらの方法論は、ゲノムリソースに関係なく、ほとんどすべての種において、費用対効果の高い方法で迅速に数千…