macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

GWAS

バリアントアノテーションを含むマンハッタンプロットを描く Manhattan++

過去10年間で、3300以上のゲノムワイド関連研究(GWAS)が行われている。ほぼすべてのGWAS研究は、主図または補足図としてマンハッタンプロットを提供している。いくつかのソフトウェアパッケージがマンハッタンプロットを生成することができるが、それらは…

全ゲノムプロットをインタラクティブに作成するShinyアプケーション shinyChromosome

2020 5/14 フィーチャー => 観測値に変更 全ゲノムの非環状プロットは、全染色体に沿って配列されたゲノムデータを自然に表現したものである。現在のところ、非環状の全ゲノム図を作成するために設計された専用のグラフィカル・ユーザー・インターフェース(…