法医学
2018
Bioinformatics
variant ranking
filtering
human exome
amplicon sequence
ASV (amplicon sequence variant)
automatic pipeline
docker
panel sequencing
法医学
tumor
somatic mutation
SNV
small indel
Precision medicine（wiki）は、患者ケアに革命をもたらす。パーソナライズドされた治療戦略は、あらゆる患者に最も適切な治療を提供するためにますます適用されている。ガンを含む遺伝的に関連する疾患に関して個別化医療を実現する重要な側面は、突然変異…
2019
PLoS ONE
ゲノム比較 (comparative genomics)
結果の視覚化 (visualization)
生物種の推定 (taxonomic profiling)
metagenome
Binning (metagenomics)
法医学
contamination
docker
2019 4/21 タイトル追加 2019 4/21 オーサーのJose Manuel Martíさんのコメント追加 2019 4/23 タイトル修正 2019 4/26 誤字修正 2019 dockerリンク追記 219 5/9 パラメータ追記 20206/13 ツイート追記 2020 6/14 condaインストール追記 メタゲノミクスによ…
マイクロサテライトまたは単純配列反復（SSR）とも呼ばれる短いタンデムリピート（STR）は、タンデム反復ユニット（1〜6 bps）を約2〜30個含む短いストレッチのDNAである。 STRは、ヒトなどの哺乳動物ゲノムを含む多くの原核生物および真核生物ゲノムに存在…
