membrane protein
tmhmm.pyはPython 3.5+で実装された transmembrane helix hidden Markov model (TMHMM) 。以下の理由で公開されている。 公開されているのはいくつかの理由がある： ソースコードが出版物の一部として入手できない、 ダウンロード可能なバイナリはLinux専用…
分子ビューアーの長い学習曲線は、研究者が初めて構造生物学の分野にアプローチする際の妨げとなっている。ここでは、次世代のオンライン分子ビューアーとして、軽量で強力かつ使いやすいインターフェースである'The Protein Imager'を紹介する。さらに、こ…
UNIfied database of TransMembrane Proteins (UniTmp)は、膜貫通タンパク質の構造情報を、タンパク質セグメントの局在、タンパク質のトポロジーから膜包埋3次元構造まで、様々なレベルで網羅的に収集した、自由にアクセス可能なリソースである。何万もの新…
2020 5/29 構成を修正、タイトル変更 2020 6/1 コマンド修正 2021 10/5 ツイート追記 マイクロバイオーム研究の重要性はますます一般的になっており、さまざまな生態系（例：海洋、構築、宿主関連など）を理解するために不可欠である。研究者は、微生物ゲノ…
biological sequences内の特徴の視覚化は、シーケンシングデータの統合分析および解釈に不可欠である。豊富なfeature annotations（例：遺伝子、プロモーター）および実験的証拠（例：RNA-Seq読み取り）のコンテキストでゲノムDNAなどの核酸配列を視覚化する…
2019 12/18 インストール追記 2022/05/20 リンク更新 TMHMMは膜貫通領域を予測するツール。膜タンパク質であるかどうかの判定にも用いられる。 マニュアル 解凍したディレクトリにユーザーガイド（TMHMM2.0.html）あり。 TMHMM2.0 インストール 依存 perl an…
