Genomics
2018
plant
Genomics
multiple sequence alignment (MSA)
automated pipeline
phylogenetic marker genes
organelle genome
circos
オルガネラの系統解析を行うためには、あらかじめアラインメントされた単一遺伝子データセットを連結したマルチ遺伝子アラインメントマトリクスを正確に構築する必要がある。しかし、数十から数百の相同遺伝子からなる高品質なマルチ遺伝子アラインメントを…
大規模な臨床および環境のメタゲノムデータセットの高速で手頃なシーケンスにより、医療およびバイオテクノロジーのアプリケーションにおける新しい視野が開かれている。今日、地球上の微生物の約1%しか記述できていないと考えられており、メタゲノム解析は…
2022/09/06 タイトル変更 一般的なウェットラボのユーザーは、ベクターNTI Advance(Life Technologies、Invitrogen、Carlsbad、CA、USA)またはLasergene SeqBuilder(DNASTAR、Madison、WI、USA)などの市販のシーケンス可視化およびアノテーションソフト…
ハイスループットシークエンシングは広範な技術となり、進化的研究を含む様々な研究分野でアクセス可能となっている。ゲノムが利用できない生物の転写産物をシーケンスし、注釈を付ける能力は、分子進化の分野における生物学者、特に非モデル生物を含むルー…