invertebrate
新着順
人気順
Methods in Ecology and Evolution
2021
web tool
phylogenetic tree viewer
education
animal
fish
plant
fungi
archaea
bacteria
worm
Insects
protists
microbial eukaryotes
small eukaryotes
protozoa
vertebrate
tree
metazoa
lineage
invertebrate
evolution
bird
arthropod
algae
amphibia
現在、「生命の樹（tree of life）」の全体像を利用できるようになったが、研究、教育、科学コミュニケーションのニーズに応えるためには、それを可視化する手法が依然として求められている。数百万もの末端（種）を持つ樹を動的に可視化するには、データの…
fish
bird
insect
Viruses
animal
human genome
archaea
bacteria
protozoa
plant
fungi
invertebrate
amphibia
shannon diversity index
lncRNA
rRNA
tRNA
GC
codon table
database
web tool
進化研究においては、生命のあらゆる領域にわたるゲノム情報の広範な調査が必要である。GenBankを通じて多数のゲノムが利用可能であるにもかかわらず、ゲノム情報の効果的な可視化や比較は、そのサイズなど多くの理由から困難である。ゲノムファイルを解析す…
2021
Nucleic Acids Research
web tool
karyogram
synteny_block
invertebrate
vertebrate
plant
fungi
dot plot
ゲノム比較 (comparative genomics)
2018
2015
2013
2010
Plant and Cell Physiology
Bioinformatics
Genomicusは、真核生物の比較ゲノミクスに特化したデータベースおよびウェブサーバである。Genomicusの主な機能は、複数のゲノム間でのゲノムブロックの保存状態をグラフィカルに表現することであり、特定の遺伝子を中心とした局所的な保存状態や、核型比較…
fungi
human genome
plant
virus
download
archaea
Viruses
protozoa
vertebrate
invertebrate
taxonomy ID
NCBI
2019 11/8 コマンドのミス修正（"Escherichia coli" => "Escherichia"） 2019 12/19 関連ツールリンク追加 タイトルの通りの機能をもつスクリプト。 インストール mac os10.13のminiconda2-4.0.5環境でテストした。 依存 本体 GIthub #anaconda環境ならconda…
