macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

invertebrate

真核生物の比較ゲノミクスのためのゲノムブラウザ Genomicus

Genomicusは、真核生物の比較ゲノミクスに特化したデータベースおよびウェブサーバである。Genomicusの主な機能は、複数のゲノム間でのゲノムブロックの保存状態をグラフィカルに表現することであり、特定の遺伝子を中心とした局所的な保存状態や、核型比較…

NCBI FTPサーバからゲノム配列をダウンロードする ncbi-genome-download

2019 11/8 コマンドのミス修正("Escherichia coli" => "Escherichia") 2019 12/19 関連ツールリンク追加 タイトルの通りの機能をもつスクリプト。 ncbi-genome-downloadに関するツイート インストール mac os10.13のminiconda2-4.0.5環境でテストした。 依…