macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

GPT

MEGAソフトウェアのための人工知能ガイダンスと分析プロトコルの構築 MEGA-GPT

過去30年の間に、MEGA(Molecular Evolutionary Genetics Analysis:分子進化遺伝学解析)ソフトウェアは、拡張し続ける機能群を備えた強力なツールへと進化してきた。しかし、ユーザーフレンドリーな設計で研究者や学生に広く採用されているにもかかわらず…

自然言語からの新規タンパク質設計を目指す Pinal

デノボタンパク質設計は、タンパク質工学における基本的な追求であるが、現在のディープラーニングアプローチは、その狭い設計範囲によって制約されたままである。Pinalは、自然言語理解とタンパク質設計空間の架け橋となり、人間の設計意図を新規タンパク質…

(ヒトとマウス)仮説生成のためにクエリに最も類似した遺伝子発現シグネチャーを検索する RummaGEO

Gene Expression Omnibus (GEO)は、トランスクリプトミクスやその他のオミックスデータセットのための主要なオープンな生物医学研究リポジトリである。現在、世界中の多くの生物医学研究ラボによって収集された数万件の研究から得られた数百万件の遺伝子発現…

>100,000の植物論文アブストラクトを網羅するナリッジネットワーク PlantConnectome

遺伝子の機能予測は生物学の理解に不可欠である。しかし、これらの予測は、実験的に特徴付けられた遺伝子の大規模なコレクションに依存しており、そのコンパイルには労力と時間がかかるだけでなく、科学文献の量と多様性を考慮すると不可能に近い。ここでは…