微生物群集の分類学的解析は、種および株レベルで十分に支持されている。しかし、種内には顕著な表現型の多様性が存在し、株は世界的な集団間で広く共有されることは稀である。種と株の間の多様性を層別化することで、「>亜種」と呼ばれる有用な中間層を特定…

環境試料中の細菌株を研究することは不可欠である。既存の方法やツールは、既知の菌株や変異株に依存していることが多く、個々のサンプルに対応できない、信頼性が低い、使い勝手が悪いなどの問題がある。そのため、より正確に菌株を同定できる、より使いや…

8/20 sambambaコマンドミス修正、varscan2バグに対応する迂回コマンド追加 1つの原核生物種のheterogeneityな集団の遺伝子型決定（genotyping）は、一般的な選択圧下での集団（populations）組成および動態に関する微生物学的問題に対処するためにますます重…