構造バリアント（SV）は進化および機能ゲノミクスにおいて重要な役割を果たすが、その特性解析は困難である。高精度のロングリードシーケンスは、効果的なコーリング手法と組み合わせることで、SVの特性解析を大幅に改善することができる。最新のロングリー…

多くの公開されている細菌ゲノムでは、染色体開始点が複製開始タンパク質に設定されていない。これは、このようなゲノム間のシンテニーを容易に評価できないため、比較ゲノム研究の負担となっている。ReCycledは、環状chromosomeの開始点を同定し、リセット…

レポジトリより wfmashはパンゲノム用のアライナーで、効率的な相同性マッピングと塩基レベルのアライメントを組み合わせている。MashMap 3.5を使用して配列間の近似マッピングを求め、WFA (Wave Front Alignment)を適用して塩基レベルのアラインメントを得…