ゲノムスケールデータから種のツリーを推定するために、要約手法が広く用いられている。しかし、推定誤差や不完全な系統分類などの生物学的プロセスの影響により、入力遺伝子ツリーが大きく不一致な場合、正確な種のツリーを生成できない可能性がある。本稿…

新しい配列をリファレンス系統樹上に配置することは、環境サンプル、特にマイクロバイオームの解析にますます利用されるようになってきている。既存の配置手法は、クエリ配列がリファレンス系統上で直接特定のモデルの下で進化してきたと仮定している。例え…